| Spieler | VfL-Top-Elf | Position | Einsätze | Tore | |
|---|---|---|---|---|---|
| Michael Schulze | Abwehr | 2 | 0 | |
| André Schürrle | Mittelfeld | 43 | 10 | |
| Zoltan Sebescen | Abwehr | 40 | 10 | |
| Paul Seguin | Mittelfeld | 26 | 1 | |
| Benjamin Siegert | Mittelfeld | 1 | 0 | |
| Jan Simunek | Abwehr | 52 | 0 | |
| Giovanni Sio | Angriff | 10 | 0 | |
| Ibrahim Sissoko | Mittelfeld | 2 | 0 | |
| Michael Spies | Mittelfeld | 22 | 2 | |
| Moritz Sprenger | Abwehr | 0 | 0 | |
| Mathias Stammann | Mittelfeld | 27 | 1 | |
| Michael Stegmayer | Abwehr | 11 | 0 | |
| Dragan Stevanovic | Angriff | 15 | 1 | |
| Sebastian Stolze | Angriff | 0 | 0 | |
| Albert Streit | Mittelfeld | 5 | 1 |